根據(jù)2020年4月學校官網(wǎng)顯示，東南大學下設34個院系、83個本科專業(yè)。

院系設置

院系專業(yè)

東南大學建筑學院

建筑學、城鄉(xiāng)規(guī)劃、風景園林

東南大學機械工程學院

機械制造、機械電子、機械設計、工業(yè)工程、工業(yè)設計、車輛工程

東南大學能源與環(huán)境學院

熱能與動力工程、建筑環(huán)境與設備工程、環(huán)境工程、核工程與核技術

東南大學信息科學與工程學院

通信與信息系統(tǒng)、信號與信息處理、電路與系統(tǒng)、電磁場與微波技術

東南大學土木工程學院

土木工程、工程管理、工程、智能建造、工程力學

東南大學電子科學與工程學院

電子科學與技術

東南大學數(shù)學學院

數(shù)學與應用數(shù)學、信息與計算科學、統(tǒng)計學

東南大學自動化學院

自動化、機器人工程

東南大學計算機科學與工程學院

計算機科學與技術

東南大學軟件學院

軟件工程

東南大學人工智能學院

人工智能

東南大學物理學院

物理學、應用物理學

東南大學生物科學與醫(yī)學工程學院

生物醫(yī)學工程、生物信息學、生物醫(yī)學工程（本碩連讀）

東南大學材料科學與工程學院

金屬材料、土木工程材料、電子信息材料、材料加工

東南大學人文學院

政治學與行政學、漢語言文學、旅游管理、社會學、哲學

東南大學經(jīng)濟管理學院

管理學類（信息管理與信息系統(tǒng)、工商管理、會計學、電子商務、物流管理）、經(jīng)濟學類（國際經(jīng)濟與貿易、金融學、經(jīng)濟學、金融工程）

東南大學電氣工程學院

電氣工程及其自動化

東南大學外國語學院

英語、日語

東南大學化學化工學院

化學工程與工藝、制藥工程、化學

東南大學交通學院

交通工程、交通運輸、道路橋梁與渡河工程、城市地下空間工程、測繪工程、港口航道與海岸工程

東南大學儀器科學與工程學院

測控技術與儀器、智能感知工程

東南大學藝術學院

產品設計、美術學、動畫

東南大學法學院

法學、工程法

東南大學醫(yī)學院

臨床醫(yī)學、醫(yī)學檢驗

東南大學公共衛(wèi)生學院

預防醫(yī)學、勞動與社會保障（醫(yī)療保險方向）

東南大學網(wǎng)絡空間安全學院

網(wǎng)絡空間安全

東南大學吳健雄學院

工科試驗班（吳健雄班，含東南大學四年制理工科類全部專業(yè)）

東南大學生命科學與技術學院

生物科學、生物工程

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